行政院食安辦主任許輔指出，邊境管制採書面審查、現場查核、取樣、檢驗4步驟把關，而食品輻射的汙染可以經儀器檢驗，高於標準才是核食，「台灣不會進口任何的核食」。他表示，台灣訂定放射能檢驗標準是全世界最嚴謹，以銫含量為例，CODEX的標準是每公斤食品1千貝克、加拿大、美國都是1千貝克以上，台灣則是1百貝克。

行政院發言人羅秉成強調，日本關切並期待台灣改變相關管制作法，包括加入CPTPP的11個會員國在內的40多個國家，都已完全解除管制，台灣無可迴避日本提出的合理訴求。日方希望能夠全部解禁，但台灣仍是採較為嚴謹態度，日本或許能勉強接受，這也是合理調整。

羅秉成並稱，此舉是台灣爭取加入跨太平洋夥伴全面進步協定（CPTPP）邁出非常重要的一步。對此，台北市長柯文哲笑稱「我們吃了萊豬，美國會跟我們簽FTA嗎？別做夢啦！吃福島地區的食品，我們就可以參加CPTPP嗎？別做夢啦！」強調「政府不要給人民不切實際的希望」，而且就算加入，農產品進口都不課稅，台灣經濟體系能否承受，這些都需要討論。

柯文哲指出，他認為福島食品要開放「沒什麼問題」，而台灣的標準雖然比美國與歐盟更嚴格，但執法嚴謹度會受質疑，「執行面的問題」，若立法從嚴執法從寬就會亂掉，呼籲中央要給清楚步驟，地方才知道怎麼做。

對於蔡政府在春節後突襲開放福島食品，國民黨團大力表達不滿，砲轟蔡政府宣稱開放核食可加入CPTPP，但日本駐台代表就曾表示「開放核食與CPTPP沒有連結」。中華民國對日逆差高達新台幣7000億元，談判本來就可以相對強勢，但是政府卻自我矮化。

國民黨團表示，行政院找御用學者花不到百萬元寫個研究報告就把所謂的「風險評估」走完過場；開放預告期由60天縮短到10天；把關核食只有「三都」有檢驗設備就急著開放，連日本國內都曾驗出輻射超標食品，目前政府從中央到地方的檢驗量能，有辦法好好為民把關嗎？地方衛生單位已為防疫忙得不可開交，貿然開放核食的結果，責任又將落到地方頭上，國民黨團嚴正拒絕蔡政府貿然開放核食。

有家長擔憂，福島食品是否可能流入校園？對此農委會主委陳吉仲表示，全台93％校園使用履歷溯源國產食材，會持續確保校園繼續使用在地食材。至於未來是否會引進福島特產、甚至舉辦相關福島食品特賣？量販業者目前普遍態度保守，家樂福、愛買都表示尊重消費者意願，全聯更直言「若民眾目前沒有需求，就不會特別引進。」