台大國發所碩士論文抄襲案繼續延燒，國安局長陳明通的去留問題儼然成為民進黨執政的燙手山芋，民進黨立委高嘉瑜被報導受訪表示「陳明通很快會下台」，不過高嘉瑜澄清她指的是內閣改組，並非陳明通個人，還為此向也曾指導過她的陳明通道歉。不過民進黨內要求陳明通下台的聲浪不斷升高，立委陳亭妃強調「該留就留、該離開就離開」，應該一次說清楚。

桃園市長鄭文燦的台大國發所碩士論文，涉及抄襲遭撤銷學位，指導教授陳明通指導過的學生也遭質疑，要求陳明通辭去國安局長下台的聲浪高漲，民進黨立委高嘉瑜在直播節目中提到，選後內閣即將改組，媒體以「高嘉瑜說陳明通很快會下台」大幅報導，引發高嘉瑜連夜在臉書PO文澄清，強調新聞標題不是她的原意，對於造成誤解和困擾要深自檢討，更要對陳明通公開致歉。

高嘉瑜強調，她是針對整個內閣未來可能改組的分析，不是針對陳明通個人，而是指內閣為了回應人民期盼，可能近期就會有改組動作。

高嘉瑜受訪強調，陳明通是她自己的恩師，對學生也很關懷、疼愛，這樣對老師非常不敬、也非常抱歉，她也有傳訊息向陳明通道歉，她說陳明通也非常體諒，還希望她好好照顧自己。

對於陳明通指導的論文被質疑有「一魚九吃」的問題，高嘉瑜說，陳明通對學生非常關愛、包容，但學生有時候也要對自己負責，老師可能提供參考方向，但最後還是要靠學生自己完成論文，把責任全歸咎於老師並不公平，相信社會也會有公評。

雖然高嘉瑜澄清緩頰，不過民進黨內要求陳明通下台的聲浪還是不斷，立委陳歐珀說，他在林智堅論文案爆發時就曾經向總統府秘書長、國安會秘書長提議，希望陳明通自動請辭，可惜當時沒被採納；如今期待陳明通既然為人師表，也應為台灣師表，對於人民這樣的聲音，應該求仁得仁，自動請辭。

同黨立委陳亭妃則說，地方基層會質疑，這種去留問題一再討論，尤其被媒體反覆討論，也是對執政的傷害，因此該怎麼做應該一次說清楚，「該留就留、該離開就離開」不要為了去留不斷變成媒體的版面。

本次九合一選舉民進黨大敗，其中最大起因就是起於林智堅的論文門，後來論文門一案，導致中間選民、青年選民對民進黨的「仇恨值」高升，乾脆不出來投票。